कोविड-19 टीकाकरण से शरीर में उत्पन्न होने वाले स्पाइक प्रोटीन को व्यापक रूप से सुरक्षित माना जाता है, चाहे वह mRNA टीके से हो (जैसे मॉडर्ना, फाइजर) या वाइरल वेक्टर टीके (जैसे, एस्ट्राजेनेका, जॉनसन एंड जॉनसन)। कोविड-19 टीकाकरण से ये स्पाइक प्रोटीन शरीर को कोविड-19 से बचाने के लिए प्रतिरक्षा प्रणाली को प्रशिक्षित करने में महत्वपूर्ण भूमिका निभाते हैं।

कोविड-19 टीकाकरण से स्पाइक प्रोटीन की विषाक्तता के बारे में झूठे दावे अक्सर अध्ययनों की गलत व्याख्या करते हैं, और इस बात पर ध्यान देने में विफल रहते हैं कि कोविड-19 टीकाकरण से स्पाइक प्रोटीन प्राकृतिक कोविड-19 संक्रमण से स्पाइक प्रोटीन की तुलना में अलग तरह से कैसे व्यवहार करते हैं।

टीके यूएस एफडीए द्वारा निर्धारित बहुत कठोर मानकों से गुजरते हैं सुरक्षा और प्रभावकारिता मानदंडों को पूरा करने के लिए। टीकों से जुड़े कोई दुष्प्रभाव या जोखिम थे या नहीं, यह समझने के लिए हजारों लोगों ने कई महीनों में नैदानिक ​​परीक्षण किए। किसी भी सुरक्षा चिंताओं के लिए या ऐसे पैटर्न के लिए टीकों की निगरानी की जा रही है जो मानव कल्याण को जोखिम में डाल सकते हैं। 

अब तक ऐसा कोई वैज्ञानिक प्रमाण उपलब्ध नहीं है जो यह बताता हो कि कोविड-19 टीकों से हमारे शरीर में बने स्पाइक प्रोटीन हमारे शरीर के अंगों को विषाक्त कर रहे हैं या क्षति पहुंचा रहे है। कोविड-19 के टीके अपेक्षाकृत नए हैं और दीर्घकालिक दुष्प्रभाव अभी ज्ञात नहीं हैं। हालांकि, इन टीकों ने कई सरकारी और अंतरराष्ट्रीय सुरक्षा एजेंसियों के सुरक्षा मानकों को पूरा किया है।

कई प्रणालियाँ हमें वैक्सीन सुरक्षा की निगरानी करने में मदद करती हैं। संयुक्त राज्य अमेरिका में इनमें वैक्सीन प्रतिकूल वृत्तांत रिपोर्टिंग सिस्टम (VAERS), द वैक्सीन सेफ्टी डेटालिंक (VSD), पोस्ट-लाइसेंस रैपिड इम्यूनाइजेशन सेफ्टी मॉनिटरिंग (PRISM), और क्लिनिकल इम्यूनाइजेशन सेफ्टी असेसमेंट प्रोजेक्ट (CISA) शामिल हैं। इन प्रणालियों का उपयोग वैज्ञानिकों द्वारा टीकों से होने वाले दुष्प्रभावों और जोखिमों के किसी अन्य पैटर्न की निगरानी के लिए किया जाता है।

संयुक्त राज्य अमेरिका में 135 मिलियन लोगों को कोविड-19 वैक्सीन दी गई है। जैसा कि किसी भी टीके से अपेक्षित था, कुछ पूर्ण टीकाकरण वाले लोग अभी भी बीमार हो गए, अस्पताल में भर्ती हुए, और/या उनकी मृत्यु हो गई। ये "दरार वाले (ब्रेकथ्रू) मामले" टीके लगाने वालों का एक बहुत छोटा प्रतिशत हैं (<0.001%) और किसी भी प्रासंगिक पैटर्न का पता लगाने के लिए अध्ययन किया जा रहा है।

अभी तक ऐसा कोई वैज्ञानिक प्रमाण उपलब्ध नहीं है जो इस दावे को पुष्ट करता हो कि टीकों से बने स्पाइक प्रोटीन हमारे रक्त प्रवाह में यात्रा करते हैं। शोध से पता चलता है कि स्पाइक प्रोटीन टीके के इंजेक्शन स्थल के आसपास की कोशिकाओं की सतह पर चिपके रहते हैं। ऐसा नहीं देखा गया है कि वे शरीर के अन्य भागों में चले जाते हैं।

टीके की एक बहुत ही छोटी खुराक इसे रक्तप्रवाह (लगभग 1%) तक पहुंचाती है, लेकिन जैसे ही यह यकृत में जाती है, वहां के एंजाइम इसे पूरी तरह से नष्ट कर देते हैं। यू.एस सीडीसी टीके से बने स्पाइक प्रोटीन को "हानिरहित" बताता है।

वैक्सीन के विकास, अनुमोदन और निर्माण में कठोर प्रक्रियाएं शामिल हैं, जिनमें से पहला सुरक्षा है। केवल तब जबकि कोई टीका सुरक्षित और प्रभावी माना जाता है, और लाभ को जोखिम से अधिक पाया जाता है, तभी उस टीके के उपयोग को अधिकृत किया जाता है। एफडीए जैसी नियामक एजेंसियों के कई वैज्ञानिक और विशेषज्ञ वैक्सीन डेटा का अध्ययन करते हैं, और यह तय करने से पहले कि क्या यह जनता के उपयोग के लिए सुरक्षित है, वैक्सीन सुरक्षा और प्रभावकारिता पर निष्कर्ष पर आते हैं।